La documentació continguda en el fons de l'Academia Médico_Práctica de Mallorca. Esta dividida en dos subfons: el subfons "Memòries" i el subfons "Documents". El Subfons "Memòries" agrupa per anys entre 1789 i 1800 ( els anys 1791-1793 no hi figuren) un conjunt de dissertacions presentades pels metges acadèmics, en les quals fan observacions i descripcions de malalties i remeis o bé topografies mèdiques d'un municipi determinat. Aquestes dissertacions son revisades críticament mitjançant una censura redactada per un acadèmic amb el rang de censor. A la documentació, disertació i censura es presenten com un únic document i van físicament lligades per l'enquadernació. No totes les dissertacions existents duen associada una censura, bé perquè no es va realitzar o bé perquè s'ha perduda. També en alguns casos es troben censures sense la corresponent dissertació, en aquest cas sempre perquè aquesta s'ha perduda. El subfons "Documents" està integrat per partes sanitaris elaborats pels metges acadèmics i que descriuen la situació sanitària dels diversos municipis de Mallorca o de la ciutat de Palma en un determinat lapse de temps. Així mateix conté correspondència remesa o rebuda per l'AMPM, corolaris meteorològics i altres informes sobre la situació higiènica i sanitària de diversos àmbits geogràfics. Actes i notes de les reunions dels òrgans de govern de l'AMPM, Inventaris i llistats i documents diversos de caràcter administratiu entorn a la institució.
La documentació continguda en el fons de la Junta Superior de Sanitat de les Illes Balears es troba dividida en una sèrie de subfons organitzats de forma temática, els quals són: Epidèmies diverses (EPI), Acords de les sessions de la Junta Superior de Sanitat (ASJ), Disposicions de la Junta Superior de Sanitat (DJS), Correspondència amb la Junta Suprema de Sanitat (SPR), Expedients de correspondència de la Junta Superior de Sanitat (ECJ), Comunicacions de la Junta Provincial de Sanitat (COJ), Càrrecs de la Junta Superior de Sanitat (CJS), Impresos emesos per la Junta Superior de Sanitat (IJS), Comptes de recaptació de drets sobre embarcacions de la ciutat d'Alcúdia (CEA), Comunicacions de la Junta de Sanitat d'Andratx (CJA) i, finalment, Documents solts de la Junta Superior de Sanitat de les Illes Balears (DSJ) Cadascun dels subfons es troba dividit al seu torn en les respectives sèries i subsèries. Dins cadascuna de les sèries els documents s'ordenen per dates de creació quedant al final aquells dels quals no consta la data.
La documentació continguda en el fons de la Pesta de 1820 es troba dividida en una sèrie de subfons organitzats de forma temática, els quals són: Correspondència (COR), Partes Sanitaris - Informes (PSI), Oficis Sanitaris i esborranys (OSE), Actes de les sessions de la Junta Superior de Sanitat durant els anys de la pesta (AJS) i Documents Diversos (DDV). Cadascun dels subfons es troba dividit al seu torn en les respectives sèries i subsèries. Dins cadascuna de les sèries els documents s'ordenen per dates de creació quedant al final aquells dels quals no consta la data.
